国务院对《快递暂行条例》进行了修改，主要改动包括：

新增第三条，规定快递业发展应遵循市场主导、保障安全、创新驱动、协同发展的原则，构建普惠城乡、技术先进、服务优质、安全高效、绿色节能的快递服务体系。

第九条改为第十条，内容调整为国家完善综合性支持政策，推进快递包装绿色化、减量化、可循环，并鼓励使用环保包装材料。

增加第六章“快递包装”，包含第三十七条至第四十五条。其中，第三十七条规定快递包装需符合寄递生产作业要求，节约资源，避免过度包装，防止污染环境。国务院标准化行政主管部门和邮政管理等部门将组织制定相关国家标准和行业标准。

第三十八条鼓励科技创新，支持研发和生产绿色环保快递包装。第三十九条要求企业优化包装方式，节约使用包装物，鼓励使用通过绿色产品认证的包装物。第四十条推动企业与商品生产企业、电子商务企业协同发展，减少二次包装。第四十一条要求企业制定并实施快递包装操作规范，培训从业人员。第四十二条要求企业制定并实施包装物回收利用管理制度，提高回收利用率。第四十三条要求企业向邮政管理部门报告一次性塑料制品使用及回收情况。第四十四条提出开展宣传教育活动，新闻媒体进行公益宣传，提高公众环保意识。第四十五条规定快递行业组织需将企业使用和回收包装物情况纳入自律范围并公布。

此外，部分条文顺序作了相应调整。例如，第五条、第六条分别改为第六条、第七条，“工商行政管理”改为“市场监督管理”。第十条改为第十一条，“城乡规划和土地利用总体规划”改为“国土空间规划”。

该决定自2025年6月1日起施行，《快递暂行条例》根据本决定作相应修改后重新公布。